地形:衢州市地质构造属江南古陆南侧,华夏古陆北缘,即跨越两个一级构造单元,中部为钱塘江凹陷地带.总的地势特征为南、北高,中部低,西部高,东部低,中部为浙江省最大的内陆盆地-金衢盆地的西半部,自西向东逐渐展宽.境内平原占15% ,丘陵占36%,山地占49%.
气候:衢州市属亚热带季风气候区,有四季分明、冬夏长春秋短、光温充足、降水丰沛季节分配不均的地带性特征.历年平均气温为17.4℃,最热月是7月,历年平均气温达28.9℃,最冷月是1月,历年平均气温5.3℃.历年极端最高气温40.5℃,极端最低气温零下10.4℃.年降水量充沛,但年际变化大,随季节分配也不均匀.年平均降水量1691.6毫米,最多年为2464.5毫米,最少年为1104.2毫米.月平均降水量最多的是6月(302.3毫米),最少的是12月(51.5毫米).月极端最多650.0毫米,月极端最少0.0毫米.全年风向多为东北偏东风,台风较难深入境内.灾害性天气主要有暴雨大暴雨、寒潮、冰雹、雷雨大风等.
动植物:衢州市植被属中亚热带东部常绿阔叶林带.境内可分两个植被区:北部山区属浙皖山丘青冈、苦槠林植被区;南部山区系浙闽山丘甜青、木荷植被区.由于受人类活动的影响,部分天然原生植被已被次生植被和人工培育植被所取代.目前主要有以松、杉为主的针叶林,以甜槠、青冈、白雪、木荷为主的常绿阔叶林,毛竹、薪炭林;域内珍贵树种有银杏、水杉、苏铁、南方红豆杉、白豆杉、金钱松、鹅掌揪、连香树、杜仲、香果树、长序榆、凹叶厚朴、闽楠、野大豆花榈木、毛江椿、长柄双花木、香樟、浙江楠、榧树、秃杉、喜树、福建柏、厚朴、山豆根、七子花、野大豆等,已列入国家级自然保护区3处,省级自然保护小区27处.经济林有油茶、板栗、柑桔、茶叶、柿等.系浙江木材、毛竹、柑桔、油茶、茶叶主要产区.
在广袤的群山中,有经济价值的野生动物30余种,列为国家一类保护的有华南虎、花山鸡;二类保护有金猫、豹、毛冠鹿、猕猴、黑麂、穿山甲、白颈长尾雉、娃娃鱼等;三类保护的有大小灵猫、獐、苏门羚、白鹇等.为促使生态与自然的平衡,相关部门采取有力措施,在各类动物的生息地分别设立了黑麂、云豹、猕猴、白鹭、灵猫、白颈长尾雉、白鹇、穿山甲、鬣羚自然保护区29处.
全市已探明储量的矿产32种,矿产地96处,其中大型矿床5处,中型矿床15处.已探明矿产中居全省前列的有石煤、石灰岩、黄铁矿、叶蜡石、大理岩、耐火粘土、铀矿等.位居全国前十位的有石煤、石灰岩矿.衢州市是浙江石灰、水泥主要产地.